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国税庁のホームページに「義援金に関する税務上の取扱いＦＡＱ」が掲載されています。
Q&Aは14ありますが、西日本豪雨等で紹介した日本赤十字社や社会福祉法人中央共同募金会へ義援金を支払った場合のQ&Aを紹介しておきます。
【日本赤十字社又は社会福祉法人中央共同募金会に対して義援金を支払った場合】
[Ｑ２]
日本赤十字社や社会福祉法人中央共同募金会が被災者への支援を目的として専用口座を設けて義援金を募集していますが、これらの口座に対して義援金を支払った場合、税務上の取扱いはどのようになりますか。[Ａ]
（個人の方が義援金を支払った場合）
日本赤十字社や社会福祉法人中央共同募金会が被災者への支援を目的として専用口座を設けて義援金を募集している場合に、その義援金が最終的に地方公共団体（義援金配分委員会等）に対して拠出されるものであるときは、個人の方が支払った義援金については、「特定寄附金」に該当し、寄附金控除の対象となります。寄附金控除額につきましては、Ｑ13をご覧ください。
なお、当該義援金は、地方公共団体に対する寄附金として、ふるさと納税に該当するため、個人住民税の寄附金税額控除の対象になります（ワンストップ特例制度の適用はできません。）。
（法人が義援金を支払った場合）
法人が、日本赤十字社や社会福祉法人中央共同募金会に対して支払った義援金
については、その義援金が最終的に義援金配分委員会等に対して拠出されることが募金趣意書等において明らかにされているものであるときは、「国等に対する寄附金」に該当し、その全額が損金の額に算入されます。（注）
日本赤十字社や社会福祉法人中央共同募金会に対して支払った義援金であっても、例えば、日本赤十字社や社会福祉法人中央共同募金会の事業資金として使用されるなど、最終的に地方公共団体に拠出されるものでないもの（財務大臣が指定する寄附金に該当しないものに限ります。）につきましては、上記と異なる取扱いになる場合があります。
詳しくは、義援金の支払先にご確認ください。（参考）
・日本赤十字社ホームページ（www.jrc.or.jp）
・社会福祉法人中央共同募金会ホームページ（www.akaihane.or.jp）［関係法令通達等］
所得税法第78条第１項、第２項
所得税基本通達78－５
法人税法第37条第３項、第４項
法人税法施行令第77条、第77条の２
法人税基本通達９－４－６
